«МАТЕРИАЛЫ 52-Й МЕЖДУНАРОДНОЙ НАУЧНОЙ СТУДЕНЧЕСКОЙ КОНФЕРЕНЦИИ МНСК–2014 11–18 апреля 2014 г. БИОЛОГИЯ Новосибирск 2014 УДК 15.010 ББК Ю 9 Конференция проводится при поддержке ...»
Установление точных форм связи между структурой генома и таксономией их носителей представляет собой важнейшую задачу современной биологии. В данной работе рассмотрены геномы хлоропластов разных растений, так как у хлоропластов одинаковая функция, сравнительная простота и одна ДНК. Целью работы является выявление связи между структурой (частотным словарём триплетов) и таксономией носителей этих геномов.
Для каждого генома строился частотный словарь. Исследовалась кластеризация частотных словарей в 63-мерном пространстве частот.
Сравнивался состав (по таксономии) выявленных кластеров, как линейных (метод динамических ядер), так и нелинейных (упругие карты).
Методом динамических ядер было выделено три группы классов. Их состав также был не случайным: в класс А попадали эвкалипт, камелия, соланин;
в класс В – рис, пшеница;
в класс С – микроводоросли (nannocloropsis), цианидиум. Объединения в группы происходили только за счет частотных словарей. Увеличение числа классов приводило к повышению детальности и устойчивости кластеризации.
Методом упругих карт были выявлены кластеры и установлена связь между их составом, определяемых по частотным характеристикам геномов хлоропластов, и таксономической близостью носителей этих геномов, попадающих в один и тот же кластер. Показано, что в кластер один попадают эвкалипт, глицин, рис, магнолия, в кластер два микроводоросль, цианеллы, цветы Pavlova, в кластер три - зелёная водоросль, селагинелла. Общее число выделяемых кластеров составляло 8.
Научный руководитель — д-р физ.-мат. наук М. Г. Садовский
ОГЛАВЛЕНИЕ
ЭКОЛОГИЯАсылбек Аян, Асылбек Асем
Б. Хонгорзул, Т. Баянмунх
Е. А. Алехин
Н. А. Залялетдинова, С. А. Антропова
С. В. Артеменко
Р. Салмырзаулы, И. А. Литус, А. М. Байбагысов, А. М. Асылбек.......... И. А. Литус, Р. Салмырзаулы, А. М. Байбагысов, А. М. Асылбек.......... Ю. С. Никулина
А. И. Бажора
A. M. Baibagysov
Н. С. Оруспай, Д. В. Балзанай
К. С. Оспанова, Б. М. Бекешева
А. П. Белобородова, М. И. Жоров
К. А. Белова, А. А. Проскурякова
К. А. Белова, М. А. Юдина
Ю. С. Белянцева, М. А. Юрьева, А. Г. Ивлева
Б. В. Бесштанько
А. Т. Бешимова
В. В. Боев
А. В. Бородин
О. Г. Булэу
В. И. Бутиков
Т. С. Васильева
А. Ю. Вдовкина, Д. А. Спашибина
И. А. Волошина
А. Н. Габышева, В. В. Сон
Е. А Робских, М. Ю. Галчанский
А. Ю. Глаголева
Е. П. Голосовская
Е. С. Голубева
В. А. Давыдова, И. М. Иванова
Д. В. Деева
Л. В. Дембовская
И. А. Махов, М. К. Дементьева
М. И. Денисюк
Н. И. Дергачева
М. В. Дойдуков
А. А. Дольский
А. Е. Дроздова
М. А. Душкин
А. Е. Егорова
Е. В. Емельяшина
А. В. Сенина, Е. В. Емельяшина
М. А. Жарникова
Е. В. Зайцева
М. А. Иванова
В. Э. Игнатьев
Л. А. Идрисова
М. К. Икласов, Т. Т. Сейсембинов
М. К. Икласов
М. Н. Сарсембенова
А. Б. Хамзина
Д. В. Казаков
К. Н. Казначеева
И. В. Калинина, О. О. Латыева
T. C. Калинина
В. А. Карамышев
Т. Г. Каргина
А. Ю. Ким
Д. В. Ким
А. С. Ковыдин
К. Д. Колесниченко
И. П. Колесов, Е. В. Дьяконов
И. П. Колесов
А. В. Коломыцева
Н. А. Колосов
О. Э. Кондакова
М. А. Корнилова
В. Ю. Коханова
А. Д. Курсаева
С. Н. Левина
А. Е. Леонова
М. И. Лялина
Е. Г. Майдорова
А. Т. Мальцева
А. А. Маслов
Н. В. Мельникова
М. Шинэцэцэг, Т. Баянмунх
Е. П. Никитина
А. И. Нуртдинова
А. В. Петров
В. А. Цапаева, Д. И. Поляков
Д. Н. Попова
С. А. Попова
С. А. Попова
И. А. Пронина
М. М. Семичаевская
А. В. Сенина
О. Н. Давиденко, Л. А. Серова
В. С. Синицина
А. М. Смирнова
Е. А. Соловьева
О. Е. Схоменко, А. А. Схоменко
О. А. Сюзева
А. А. Томишина
А. П. Ужакина, М. Н. Клещевникова
Н. В. Фёдорова
И. Г. Фролов
М. Д. Шамаева
Г. М. Шарафиева
И. М. Шепелева
К. В. Широкова
ФИЗИОЛОГИЯ ЧЕЛОВЕКА И ЖИВОТНИХ
К. М. Ачасова
Ю. А. Бабушкина
А. В. Бакланов
М. С. Бирюкова
И. К. Бирюля, Е. А. Минуйкин
С. А. Борисов
С. О. Вечкапова, Е. Д. Сорокоумов
И. В. Гаранжа
А. В. Гофман
А. С. Долодоев
А. Д. Дубинина
М. А. Золотых
Е. А. Казак, Е. А. Васькова
Н. В. Карпов
Е. А. Кривошеина
М. С. Кузнецова
И. А. Михайленко
А. В. Наговицин
Т. В. Нечаева
Д. С. Рагаева
Р. Д. Рустамов
А. Е. Сапрыгин
С. В. Сивцева
Е. И. Соловьева, Е. А. Прокопьева
Н. В. Холодина, Е. Д. Николенко, А. Ш. Подойников
В. С. Цымпилов
С. В. Шилов, Л. Н. Иванова, Н. В. Зубенко, Р. А. Паренова.................. В. С. Шилова, Т. А. Головко
А. Ю. Юнусова
ЦИТОЛОГИЯ И ГЕНЕТИКА
Д. А. Андреюшкова
В. В. Широкова, Г. Н. Артемов
Н. С. Барабанщикова
Н. С. Воробьева
К. В. Герасимова
О. М. Игнатенко
А. А. Кондюков, Е. Д. Шедько
А. В. Кононов, К. В. Устьянцев
Ю. В. Косарева
М. Е. Култышева
В. А. Лукьянчикова
Т. Б. Маланханова, А. А. Немудрый
Д. Д. Новикова
А. А. Роговая
И. С. Сухих
М. А. Цыганов
С. В. Черданцев
А. А. Шевцова
МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ И БИОХИМИЯ
З. Р. Абдусаламова, З. К. Койсултанова, А. З. Муртазаева
А. А. Андреева, Е. В. Кучарова, П. А. Ноговицын, С. И. Алексеева..... М. О. Барсукова
Э. Е. Бекенова, А. К. Туякова, А. Т. Сукашев, А. А. Логвиненкo.......... А. А. Беленко, К. А. Кравченко, А. С. Уразова
Е. Е. Буркова
Н. А. Бурмистрова, Н. В. Твердохлеб
В. Е. Веселов
И. В. Воронова
А. В. Юдкина
Е. А. Ермаков
С. С. Зайнутдинов
К. А. Иванова, Д. В. Шаньшин
М. К. Иманбекова, Г. Н. Кулмамбетова, А. А. Логвиненко, А. Т. Сукашев
Р. Д. Касымов
Т. Ю. Китаева
О. А. Кладова
Е. А. Лехнов
I. A. Litus
Н. К. Лукьянчикова
А. М. Минкевич
А. Д. Мирошникова
А. И. Неуместова
Т. Е. Панкова
А. В. Разуваева
А. П. Рудометов;
А. Н. Чикаев
А. С. Тихонова, Е. А. Сергеева
С. О. Тамара
А. В. Ткачёва
О. С. Тутанов
Т. Е. Тюгашев
Е. Д. Шедько
БИОИНФОРМАТИКА
С. Ж. Шарапов, Я.А. Цепилов, Я.С. Риед, К. Страух, К. Гигер............. А. В. Аникеев
Т. С. Троеглазова, Д. Ж. Байшыбаев
А. А. Витвицкий
Д. С. Грудин
А. И. Клименко
Е. В. Кулакова
Е. А. Масальская
З. С. Мустафин
К. А. Никитина
Н. С. Сафронова
А. М. Спицина
О. А. Черных
А. И. Чернышова
МАТЕРИАЛЫ
52-Й МЕЖДУНАРОДНОЙ НАУЧНОЙ
СТУДЕНЧЕСКОЙ КОНФЕРЕНЦИИ
БИОЛОГИЯ
Материалы конференции публикуются в авторской редакции Подписано в печать 02.04.2014 г.Формат 60x84/16. Уч.-изд. л. 13,8. Усл. печ. л. 12,8.
Редакционно-издательский центр НГУ.
630090, г. Новосибирск, ул. Пирогова, 2.
«