БЕСПЛАТНАЯ БИБЛИОТЕКА РОССИИ

НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКИЕ КОНФЕРЕНЦИИ

<< ГЛАВНАЯ
АСТРОНОМИЯ
БЕЗОПАСНОСТЬ
БИОЛОГИЯ
ЗЕМЛЯ
ИНФОРМАТИКА
ИСКУССТВОВЕДЕНИЕ
ИСТОРИЯ
КУЛЬТУРОЛОГИЯ
МАШИНОСТРОЕНИЕ
МЕДИЦИНА
МЕТАЛЛУРГИЯ
МЕХАНИКА
ПЕДАГОГИКА
ПОЛИТИКА
ПРИБОРОСТРОЕНИЕ
ПРОДОВОЛЬСТВИЕ
ПСИХОЛОГИЯ
РАДИОТЕХНИКА
СЕЛЬСКОЕ ХОЗЯЙСТВО
СОЦИОЛОГИЯ
СТРОИТЕЛЬСТВО
ТЕХНИЧЕСКИЕ НАУКИ
ТРАНСПОРТ
ФАРМАЦЕВТИКА
ФИЗИКА
ФИЗИОЛОГИЯ
ФИЛОЛОГИЯ
ФИЛОСОФИЯ
ХИМИЯ
ЭКОНОМИКА
ЭЛЕКТРОТЕХНИКА
ЭНЕРГЕТИКА
ЮРИСПРУДЕНЦИЯ
ЯЗЫКОЗНАНИЕ
РАЗНОЕ
КОНТАКТЫ

загрузка...

Pages:     | 1 |   ...   | 21 | 22 || 24 | 25 |   ...   | 28 |

«МАТЕРИАЛЫ 52-Й МЕЖДУНАРОДНОЙ НАУЧНОЙ СТУДЕНЧЕСКОЙ КОНФЕРЕНЦИИ МНСК–2014 11–18 апреля 2014 г. БИОЛОГИЯ Новосибирск 2014 УДК 15.010 ББК Ю 9 Конференция проводится при поддержке ...»

-- [ Страница 23 ] --

Под действием различных факторов в ДНК возникают повреждения, которые могут приводить к мутациям или гибели клетки. Этим процессам противодействует система репарации ДНК. Некоторые ферменты данной системы способны с высокой точностью узнавать и выщеплять из ДНК неповрежденные азотистые основания в составе неканонических пар. На их основе можно создать высокоэффективный метод детекции SNP.

Целью настоящей работы является разработка системы определения однонуклеотидных полиморфизмов на основе ферментов репарации ДНК.

В ходе исследования фермент MutY E. coli и каталитический фрагмент фермента TDG человека были получены в рекомбинантном виде. В ПЦРкопии двух экзонов гена рецептора андрогенов (AR) человека были внесены однонуклеотидные замены, которые идентичны SNP, ассоциированным с рядом заболеваний. Эффективность метода показана путем анализа полученных ДНК-фрагментов разрабатываемым методом.

В работе показана эффективность метода детекции SNP на основе ферментов репарации ДНК в модельной системе гена AR человека.

Научный руководитель – д-р биол. наук, доцент Д. О. Жарков

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ МЕТОДА УСКОРИТЕЛЬНОЙ МАССh2>

СПЕКТРОМЕТРИИ ДЛЯ АНАЛИЗА РАСПРЕДЕЛЕНИЯ 14Сh2>

МЕЧЕНОГО МЕТАНОЛА В ТКАНЯХ ЖИВОТНЫХ

Новосибирский государственный университет Институт молекулярной биологии и биофизики СО РАМН сверхчувствительного анализа изотопного состава вещества, при этом измеряемая концентрация радиоактивного изотопа может составлять 10121014 в сравнении с основным изотопом. Этот метод позволяет проводить токсикологические исследования, а также исследовать фармакокинетику и распределение вводимых в организм углеродных меток в тканях животных с высокой степенью точности.

В настоящее время среди токсикологических исследований особое место занимает метанол, которому посвящено достаточное количество работ в связи с его высокой летальностью для человека. Известно, что этот спирт окисляется в печени алкогольдегидрогеназой до формальдегида и (в считанные минуты) до муравьиной кислоты.

В настоящей работе впервые с помощью УМС изучалось распределение 14C-метки в разных органах мышей СВА в течение 1, 3, 10 и 24 часов после внутрибрюшинного введения 14C-метанола.

Графитизированные образцы печени, почек, головного мозга для анализа на ускорительном масс-спектрометре готовили по оригинальной методике. Получаемые образцы содержали в своем составе более 85% углерода от его количества в исходных образцах. Во всех исследуемых органах мышей после введения им 14C-метанола радиоактивностью 20 Бк, концентрация радиоуглерода в разы превышает естественную. После введения 14С меченого метанола объемом 20 мкл, содержание метанола и его метаболитов в печени оставалось стабильно высоким (400-500 мг/кг) в течение всего исследуемого интервала времени, тогда как в головном мозге этот показатель к 24-ем часам снизился до 40 мг/кг. Кинетика элиминации метанола и его метаболитов из почек была замедлена по сравнению с головным мозгом: к 24-ем часам до уровня 100 мг/кг.

Таким образом, впервые была показана кинетика элиминации метанола и его метаболитов из разных органах мышей с помощью ускорительной масс-спектрометрии.

Научные руководители – д-р биол. наук Л. Ф. Гуляева, канд. хим. наук П. Н. Калинкин

ИЗУЧЕНИЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ДНК ПОЛИМЕРАЗ С ДНКh2>

БЕЛКОВЫМИ СШИВКАМИ

Новосибирский государственный университет Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН ДНК живых организмов постоянно подвергается воздействию различных экзогенных и эндогенных генотоксических агентов. Одно из распространенных повреждений ДНК - ДНК-белковые сшивки - возникает под воздействием ряда факторов: химических (альдегиды, ионы тяжелых металлов), физических (ионизирующее излучение, УФ), а также в результате ковалентного присоединения ферментов (таких как метилтрансферазы, топоизомеразы) при ошибках в их работе. Кроме того, недавно было показано, что при процессинге некоторых окислительных повреждений репаративными ДНК полимеразами происходит их ковалентный захват, что также приводит к формированию ДНК-белковых сшивок. Как чрезвычайно объемные аддукты, сшивки мешают многим процессам метаболизма ДНК, в том числе репликации, транскрипции и релаксации. Однако взаимодействие клеточных механизмов с этим видом повреждений остается малоизученным из-за отсутствия хороших экспериментальных моделей.

Целью работы было создание высокоэффективной модели сшивки белка с ДНК и анализ проходимости белкового барьера рядом ДНК полимераз.

Для создания высокоэффективной модели сшивки в данной работе к олигонуклеотидному дуплексу, содержащему 8-оксогуанин (8-oxoGua) добавляли формамидопиримидин-ДНК гликозилазу (Fpg) Escherichia coli (E. coli) в присутствии борогидрида натрия. Затем исследовали процесс прохождения места сшивки такими ферментами как фрагмент Кленова ДНК-полимеразы I E. coli, ДНК-полимеразой человека, термофильными ДНК-полимеразами Taq и Pfu, ДНК-полимеразой фага Т4.

В результате проведенных экспериментов было показано, что ДНКполимеразы были неспособны обойти белковый аддукт и останавливались, если он находился в матричной цепи, но эффективно вели синтез, если сшивка была в комплиментарной цепи, и это подтверждает способность изучаемых полимераз изгибать перед собой ДНК, содержащую даже такие объемные аддукты, как ДНК-белковые сшивки.

Научный руководитель – д-р биол. наук Д. О. Жарков

АНТИТЕЛА-ОКСИДОРЕДУКТАЗЫ ПРИ ШИЗОФРЕНИИ И

РАССЕЯННОМ СКЛЕРОЗЕ

Новосибирский государственный университет Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН Каталитически активные антитела (АТ), или абзимы, обнаружены у больных различными аутоиммунными, инфекционными заболеваниями, а также в молоке здоровых рожениц, и являются перспективным средством диагностики различных заболеваний. Показано, что АТ из крови млекопитающих обладают оксидоредуктазными активностями и способны образовывать перекись водорода из молекулярного кислорода. Изучение роли АТ-оксидоредуктаз в патогенезе таких социально значимых заболеваний, как шизофрения и рассеянный склероз (РС), является актуальным.

В настоящей работе исследована оксидоредуктазная активность препаратов IgG, выделенных из сыворотки крови у больных шизофренией, пациентов с РС и здоровых доноров. Впервые показано, что АТ при данных патологиях обладают каталазной (КАТ), супероксиддисмутазной (СОД) и глутатионпероксидазной (ГП) активностью. На основе анализа сродства к аффинному сорбенту, гомогенности выделенных IgG и их гельфильтрации в условиях pH-шока доказано, что исследуемые активности являются собственным свойством антител. Было установлено, что IgG больных РС и шизофренией обладают КАТ активностью в 3 и 5 раз выше соответственно, чем у здоровых лиц. СОД и ГП активность антител у больных РС и шизофренией была выше в 2–4 раза по сравнению с группой здоровых. На основании данных ингибиторного анализа каталазной активности можно предположить о наличии гистидина в каталитическом участке активного центра IgG. При анализе кинетических параметров каталазной реакции, катализируемой IgG, получены величины Km, значительно меньшие, чем у нативных ферментов.

Полученные результаты позволяют предположить участие IgG в регуляции окислительного стресса при шизофрении и РС.

Работа поддержана Программой фундаментальных исследований Президиума РАН "Молекулярная и клеточная биология" № 6.2, Междисциплинарным интеграционным проектом СО РАН № 59, а также грантами РФФИ № 13-04p>

Научный руководитель – д-р биол. наук, проф. В. Н. Бунева, канд. мед.

наук Л. П. Смирнова

СПЕКТР АДАПТИВНЫХ МУТАЦИЙ ВИРУСА СЕНДАЙ

ПРИ КУЛЬТИВИРОВАНИИ НА КУЛЬТУРАХ КЛЕТОК

Новосибирский государственный университет Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»

Существуют вирусы, обладающие выраженными онколитическими свойствами, например, вирусы болезни Ньюкасла и Сендай, а также некоторые штаммы вирусов кори, энтеровирусов и другие. Многие из них нарабатываются на куриных эмбрионах, однако препараты, полученные таким образом, могут вызывать аллергические реакции из-за присутствия большого количества куриного белка. Одно из решений проблемы – наработка вирусов на культурах клеток.

Онколитические свойства штамма Sen onco вируса Сендай изучались в Институте вирусологии им. Д. И. Ивановского РАМН и Онкологическом научном центре РАМН. В Москве в 1980–90-х гг. этот штамм применялся для терапии безнадёжно больных людей со злокачественными опухолями.

Культивирование штамма Sen onco проводилось на куриных эмбрионах.

Данная работа посвящена выявлению адаптивных мутаций штамма Sen onco при культивировании на клетках 293 и 4647, аттестованных для производства вакцин в России. В результате адаптации были получены штаммы Sen293nsk1 и Sen293nsk1310, прошедшие 21 и 10 пассажей на клетках 293 соответственно, и штамм Sen4647mos25, прошедший пассажей на клетках 4647. Для этих штаммов проведено полногеномное секвенирование (15384 н.) и сравнительный анализ структуры со следующими результатами:

1. Все культуральные штаммы гетерогенны и представляют смесь нескольких клонов вируса.

2. Спектр мутаций отличается между штаммами, адаптированными к разным культурам клеток (293 и 4647), и достаточно сильно совпадает при независимых актах культивирования исходного вируса на одной культуре клеток (293). Другими словами, у Sen293nsk1 и Sen293nsk1310 мутации очень сходны между собой, а у Sen4647mos25 спектр мутаций иной.

3. Наибольшая плотность мутаций наблюдается в генах поверхностных белков. С помощью реакции торможения гемагглютинации было показано, что эти мутации существенно изменяют антигенные свойства вируса.

Научный руководитель – д-р биол. наук Г. В. Кочнева

КОНСТРУИРОВАНИЕ ФАГМИДНОГО ВЕКТОРА

ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ БИБЛИОТЕКИ МИНИ-АНТИТЕЛ

Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»

Препараты на основе моноклональных антител успешно применяются для терапии вирусных, аутоиммунных и онкозаболеваний. Антитела – незаменимые реагенты для диагностики и обнаружения следовых количеств веществ. Использование гибридомной технологии для получения моноклональных антител имеет ряд недостатков, некоторые их которых можно преодолеть с помощью техники фагового дисплея.

Технология фагового дисплея, с использованием in vitro аффинной селекции, позволяет находить последовательности вариабельных доменов тяжелой и легкой цепей антител, которые распознают мишень с высокой точностью. Принципы фагового дисплея – это конструирование обширной библиотеки антител (на основе вирионов) и скрининг ее с целью поиска интересующего варианта. Библиотека создается путем клонирования генов вариабельных доменов тяжелой и легкой цепей антител в составе конструкции на основе плазмидного вектора.

В работе был сконструирован вектор на основе фагмиды pBluescript II.

Из полилинкера фагмиды были удалены два сайта рестрикции, которые ограничивали возможность встройки целевых нуклеотидных последовательностей. Для последующего клонирования с использованием сайт-направленного мутагенеза была введена нуклеотидная последовательность, соответствующая сайту рестрикции Age I. Для первичного анализа полученных клонов был проведен рестрикционный анализ. Данные гель-электрофореза продуктов гидролиза ДНК показали наличие введенного сайта, и успешное удаление ограничивающих встройку сайтов. Для окончательного подтверждения этих результатов было проведено определение нуклеотидной последовательности плазмидной ДНК отобранных клонов.

В состав полученного вектора была встроена синтетическая последовательность ДНК, содержащая сайты для клонирования «генов»

вариабельных доменов легкой и тяжелой цепей антител, а также дополнительные регуляторные элементы, обеспечивающие эффективную экспрессию.

В результате работы сконструрован вектор, который будет использован для получения библиотек мини-антител человека.

Научный руководитель – канд. биол. наук Д. Н. Щербаков

ПОЛИМОРФИЗМ ПРОМОТОРНОЙ ОБЛАСТИ ГЕНА IL -

АССОЦИИРУЕТСЯ С РАЗВИТИЕМ ХРОНИЧЕСКОГО ГАСТРИТА

В КАЗАХСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ

М. К. Иманбекова, Г. Н. Кулмамбетова, А. А. Логвиненко, А. Т. Сукашев Национальный центр биотехнологии, г. Астана Национальный научный медицинский центр, г. Астана Введение. Аллельные варианты генов цитокинов, как было показано ранее, влияют на экспрессию генов, и впоследствии на восприимчивость и тяжесть инфекционных заболеваний. Воспалительный процесс является естественным ответом организма хозяина в ответ на микробную инвазию.

Однако длительно персистирующее воспаление приводит к нарушению структуры и функций тканей желудка, что в свою очередь сопутствует развитию его патологий. IL-10 – это многофункциональный противовоспалительный цитокин, который подавляет клеточноопосредованный иммунный ответ и цитотоксические воспалительные реакции. В промоторной области данного гена расположены три полиморфизма в положениях -1082 (GA), -819 (CT), -892 (TC), которые в исследованиях зарубежных ученых ассоциированы пониженной секрецией данного цитокина и риском развития желудочно-кишечных заболеваний. Целью исследования было определить ассоциацию риска развития хронического гастрита и полиморфизмов гена IL-10.

Материалы и методы. В исследовании участвовали 233 человека, пациенты Национального научного медицинского центра (г. Астана) в возрасте от 13 до 86 лет с диагнозом хронический гастрит. Контрольной группой, 260 человек, являлись условно здоровые люди, в анамнезе которых диагноз патологий ЖКТ отсутствовал. От обследуемых людей было получено информированное согласие на участие в исследовании.

Экстракцию ДНК из клинического материала проводили методом высаливания. Генотипирование проводили с помощью ПЦР в режиме реального времени с использованием TaqMan зондов.

Результаты. В результате проведенного исследования была обнаружена ассоциация развития хронического гастрита в казахской популяции с генотипом TT гена IL-10-819 [OR=2.83 (1,59-5,09), p=0.0031].

Исследование полиморфизмов в положении -1082 и -592 положительной ассоциации не выявило. Раннее, работами зарубежных ученых данная ассоциация была обнаружена в китайской, корейской и японской популяциях. Однако, исследование европейской популяции не подтвердило корреляцию развития гастрита с генотипом ТТ гена IL-10p>

Научный руководитель - Г. Н. Кулмамбетова

ВЛИЯНИЕ МЕТИЛИРОВАНИЯ ДНК НА ЭФФЕКТИВНОСТЬ

ДЕЙСТВИЯ 8-ОКСОГУАНИН-ДНК-ГЛИКОЗИЛАЗЫ ЧЕЛОВЕКА

Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН Метилирование ДНК, основная эпигенетическая модификация в геномах всех известных позвоночных, лежит в основе таких важных биологических процессов как регуляция экспрессии генов, структуры ДНК, а также контроль мобильных элементов. Мишенями для эпигенетического метилирования в геноме человека, в результате которого образуется 5-метилцитозин, являются CpG динуклеотиды.

Гуанин в этом контексте может быть легко окислен до 8-оксогуанина, одного из самых частых окислительных повреждений ДНК, который репарируется специальной ферментативной системой (GO-системой), центральным элементом которой у эукариот является 8-оксогуанин-ДНКN-гликозилаза (OGG1).

Каждый из этих процессов довольно полно описан в современной литературе, однако взаимное влияние метилирования ДНК и экцизионной репарации оснований еще малоизученно.

Данная работа посвящена исследованию влияния метилирования ДНК на эффективность эксцизионной репарации оснований. Целью работы было изучение активности OGG1 в реакциях расщепления ДНКсубстратов, содержащих 8-оксогуанин в контексте CpG и отличающихся статусом метилирования по CpG-динуклеотиду.

В работе показано, что метилирование по соседнему относительно 8оксогуанина положению умеренно снижает скорость выщепления основания, тогда как метилирование напротив 8-оксогуанина снижает скорость высвобождения продукта. Также метилирование цитозина полностью блокирует стимулирование OGG1 репаративной эндоклеазой APEX1. Реконституция процесса эксцизионной репарации с помощью рекомбинантных белков показала, что общая эффективность эксцизионной репарации оснований снижена для субстратов, содержащих 5метилцитозин в CpG динуклеотите поврежденной цепи.

Научный руководитель – д-р биологических наук, доцент Д. О. Жарков

ВНЕЛИСТОВЫЕ ПИГМЕНТЫ ПОБЕГОВ ДРЕВЕСНЫХ И

КУСТАРНИКОВЫХ РАСТЕНИЙ В ОСЕННИЙ ПЕРИОД



Pages:     | 1 |   ...   | 21 | 22 || 24 | 25 |   ...   | 28 |
 


Похожие материалы:

«СОВРЕМЕННЫЕ ТЕНДЕНЦИИ В НАУКЕ И ОБРАЗОВАНИИ Сборник научных трудов по материалам Международной научно-практической конференции Часть IV 3 марта 2014 г. АР-Консалт Москва 2014 1 УДК 001.1 ББК 60 Современные тенденции в науке и образовании: Сборник науч- С56 ных трудов по материалам Международной научно-практической конфе- ренции 3 марта 2014 г. В 6 частях. Часть IV. М.: АР-Консалт, 2014 г.- 172 с. ISBN 978-5-906353-82-5 ISBN 978-5-906353-86-3 (Часть IV) В сборнике представлены результаты ...»

«Палинологическая школа-конференция с международным участием МЕТОДЫ ПАЛЕОЭКОЛОГИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ (Москва, 16-19 апреля 2014) Тезисы докладов International Palynological Summer School METHODS OF PALAEOENVIRONMENTAL RESEARCHES (Moscow, April, 16-19, 2014) Book of abstracts Москва – 2014 УДК 561: 581.33:551.71/.78 Методы палеоэкологических исследований. Тезисы докладов палинологической школы-конференции с международным участием / Ред. А.А. Величко, Н.С. Болиховская, Е.Ю. Новенко, С.С. Фаустов. ...»

«ФОРМИРОВАНИЕ ЭКОЛОГИЧЕСКОЙ КУЛЬТУРЫ И СРЕДА ОБИТАНИЯ НА ТЕРРИТОРИИ УРБОЭКОСИСТЕМ Сборник материалов Всероссийской научной конференции с международным участием (27–28 сентября 2012 года) Шуя 2012 УДК 502.52 Печатается по решению редакционно-издательского совета ББК 28.08 ФГБОУ ВПО Шуйский государственный педагогический Ф 43 университет Ф 43 Формирование экологической культуры и среда обита- ния на территории урбоэкосистем: Сборник материалов Всероссий- ской научной конференции (г. Шуя, 27-28 ...»






 
© 2013 www.kon.libed.ru - «Бесплатная библиотека научно-практических конференций»