БЕСПЛАТНАЯ БИБЛИОТЕКА РОССИИ

НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКИЕ КОНФЕРЕНЦИИ

<< ГЛАВНАЯ
АСТРОНОМИЯ
БЕЗОПАСНОСТЬ
БИОЛОГИЯ
ЗЕМЛЯ
ИНФОРМАТИКА
ИСКУССТВОВЕДЕНИЕ
ИСТОРИЯ
КУЛЬТУРОЛОГИЯ
МАШИНОСТРОЕНИЕ
МЕДИЦИНА
МЕТАЛЛУРГИЯ
МЕХАНИКА
ПЕДАГОГИКА
ПОЛИТИКА
ПРИБОРОСТРОЕНИЕ
ПРОДОВОЛЬСТВИЕ
ПСИХОЛОГИЯ
РАДИОТЕХНИКА
СЕЛЬСКОЕ ХОЗЯЙСТВО
СОЦИОЛОГИЯ
СТРОИТЕЛЬСТВО
ТЕХНИЧЕСКИЕ НАУКИ
ТРАНСПОРТ
ФАРМАЦЕВТИКА
ФИЗИКА
ФИЗИОЛОГИЯ
ФИЛОЛОГИЯ
ФИЛОСОФИЯ
ХИМИЯ
ЭКОНОМИКА
ЭЛЕКТРОТЕХНИКА
ЭНЕРГЕТИКА
ЮРИСПРУДЕНЦИЯ
ЯЗЫКОЗНАНИЕ
РАЗНОЕ
КОНТАКТЫ

загрузка...

Pages:     | 1 |   ...   | 19 | 20 || 22 | 23 |   ...   | 28 |

«МАТЕРИАЛЫ 52-Й МЕЖДУНАРОДНОЙ НАУЧНОЙ СТУДЕНЧЕСКОЙ КОНФЕРЕНЦИИ МНСК–2014 11–18 апреля 2014 г. БИОЛОГИЯ Новосибирск 2014 УДК 15.010 ББК Ю 9 Конференция проводится при поддержке ...»

-- [ Страница 21 ] --
Новосибирский государственный университет Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск Актуальным направлением современной биомедицины является клеточная терапия генетических заболеваний. В настоящее время развиты методики для получения индуцированных плюрипотентных стволовых клеток из дифференцированных клеток при жизни пациента. С помощью искусственных нуклеаз возможно направленно производить двунитевые разрывы в целевых сайтах. Вследствие таких разрывов при внесении донорной молекулы ДНК в клетку повышается эффективность гомологичной рекомбинации, за счет которой можно добиться исправления мутации. В дальнейшем клетки с исправленной мутацией можно использовать в качестве материала для клеточной терапии.

В данной работе объектом для проведения таких экспериментов являются крысы линии Brattleboro, несущие мутацию которая вызывает наследственное заболевание — несахарный гипоталамический диабет.

Целью данного исследования является исправление мутации в клетках крыс этой линии с использованием системы CRISPR/Cas9 для внесения двунитевых разрывов.

В качестве донорных молекул для гомологичной рекомбинации будут использованы искусственно синтезированные одноцепочечные олигонуклеотиды, которые заменят участок гена AVP, содержащий мутацию. Для внесения разрывов в целевые сайты получены конструкции, секвенирование конструкций для проверки правильности их последовательности. Для определения активности полученных систем CRISPR/Cas9 проведен анализ эндонуклеазой I фага T7 и анализ кривой плавления с высоким разрешением (High resolution melt analysis).

Проведенные анализы показали, что система CRISPR/Cas9 активна в целевых сайтах генома крыс линии Brattleboro и может быть использована для исправления мутации. В последующих работах будет проведено исправление мутации в плюрипотентных клетках крыс линии Brattleboro, которые ранее были получены на более ранних этапах проекта, частью которого является данная работа.

Научный руководитель – канд. биол. наук С. П. Медведев

ФИЛОГЕНИЯ ГЕНОВ СЕМЕЙСТВА MAKR И ИХ ЭКСПРЕССИЯ

У ARABIDOPSIS THALIANA L.

Новосибирский государственный университет Тирозин-киназные рецепторы и мембран-ассоциированные регуляторы киназ являются важными посредниками во многих сигнальных путях, в том числе и в передаче сигналов от фитогормонов. Недавно у Arabidopsis Thaliana L. было обнаружено новое семейство мембран-ассоциированных регуляторов киназ (MAKR), являющихся дальними гомологами регулятора рецептора к брассиностероидам BKI1[1].

Целью данной работы является анализ особенностей экспрессии и филогении генов семейства MAKR A. thaliana. В первую очередь мы провели филогенетический анализ генов семейства MAKR в царстве растений. Также были проанализированы данные микроаррэй экспериментов по изменению экспрессии генов семейства MAKR при обработке проростков растений различными гормонами. Мы приступили к измерению уровней экспрессии паралогов семейства MAKR в разных тканях методом количественной ПЦР.

Филогенетический анализ показал, что гены семейства MAKR широко распространены в геномах растений. Анализ экспрессии генов MAKR показал их чувствительность к ряду гормонов: гибберелинам, цитокинину, брассинолиду, предшественнику этилена, ауксину и абсцизовой кислоте.

Причем изменения экспрессии отличаются при обработке разными концентрациями гормонов и в зависимости от времени их воздействия.

Микроаррей данные по ауксин-чувствительности гена MAKR4 были подтверждены методом количественной ПЦР.

Мембран-ассоциированные регуляторы киназ выступают как потенциально важные мишени в регуляции развития растений. Их транскрипция изменяется под действием фитогормонов. Полученные фундаментальные знания могут быть использованы в поиске новых регуляторов роста растений и гербицидов.

1. Yvon Jaillais, Youssef Belkhadir, Tsegaye Dabi, Zachary L. Nimchuk, Elliot M. Meyerowitz, Joanne Chory. GENES & DEVELOPMENT, 2010, 25:232–237.

Научный руководитель - канд. биол. наук В. В.Миронова

ФОРМИРОВАНИЕ ВЕРЕТЕНА ДЕЛЕНИЯ В МЕЙОЗЕ

ПШЕНИЧНО-РЖАНЫХ ПОЛИГАПЛОИДОВ

Новосибирский государственный университет Фундаментальной биологической функцией, которую выполняет веретено деления, является равное разделение хромосом между дочерними клетками. В мейозе веретено обеспечивает редукцию хромосом в первом делении и их эквационную сегрегацию во втором, что является необходимым условием для образования фертильной пыльцы. У отдаленных гибридов первого поколения (полигаплоидов) в отсутствие гомологов редукции числа хромосом не происходит, мейоз нарушен, растения стерильны. Тем не менее, их частичная фертильность может быть обусловлена образованием реституционных ядер. В связи с этим, полигаплоиды служат ценным источником аномалий мейоза весьма информативных не только с точки зрения выявления новых аспектов динамики микротрубочкового цитоскелета, но и для исследования его роли в механизмах мейотической реституции. Целью данной работы являлось изучение механизмов формирования и реорганизации систем микротрубочек, функционирующих в процессе построения веретена деления. Установлено, что формирование биполярных фибрилл веретена деления в мейозе ржи, пшеницы и пшенично-ржаных гибридов происходит в результате реорганизации микротрубочковых пучков промежуточной перинуклеарной системы цитоскелета. Показано, что цикл реорганизации цитоскелета в первом и втором делениях мейоза осуществляется посредством реорганизации двух основных цитоскелетных структур: радиального интерфазного цитоскелета и веретена деления. Фрагмопласт как самостоятельная структура не строится, для его формирования используются микротрубочки веретена и радиальной системы. Выявлен ряд аномалий в формировании веретен деления у пшенично-ржаных гибридов, таких как нарушение конвергенции полюсов, нарушение профиля микротрубочковых пучков (С–образные веретена), формирование монополярных веретен, нарушение взаимодействия (+)-концов микротрубочек с кинетохорами хромосом.

Научный руководитель - канд. биол. наук. Ю. В. Сидорчук

ИССЛЕДОВАНИЕ ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИХ

ВЗАИМООТНОШЕНИЙ НАДСЕМЕЙСТВА ACRIDOIDEA

Новосибирский государственный университет Институт цитологии и генетики СО РАН Систематика, реконструкция филогенетических отношений и представления об эволюции саранчовых (надсемейство Acridoidea) долгое время складывались преимущественно на основе сравнительного анализа ключевых морфологических структур рецентных и ископаемых видов. В результате были разработаны многие эволюционно-филогенетические модели развития этих насекомых на уровне таксонов высокого ранга. Однако на уровне семейств, подсемейств или триб появляются проблемы конвергенции и параллелизма у данных насекомых.

С помощью сравнительно-кариологических исследований оказалось невозможным определение плезиоморфных и апоморфных модальностей цитогенетических признаков даже для подсемейств семейства Acrididae. Использование методов, основанных на анализе нуклеотидных последовательностей, позволило решить эту проблему т. к. такие методы позволяют оценить уровень дивергенции в таксонах любого ранга. Одним из самых эффективных методов для определения филогенетических взаимоотношений является анализ митохондриальной ДНК, из-за высокой копийности, отсутствия рекомбинации и наличия разных мутационных уровней в разных частях молекулы.

В настоящей работе был проведен молекулярно-филогенетический анализ митохондриальных (COI, COII) и ядерных (ITS) нуклеотидных последовательностей из 102 видов надсемейства Acridoidea и установлены их филогенетические взаимоотношения.

Научный руководитель - канд. биол. наук А. Г. Блинов

ИДЕНТИФИКАЦИЯ БЕЛКОВ КЛЕТОЧНОЙ СЕКРЕТОРНОh2>

ЭКСКРЕТОРНОЙ СИСТЕМЫ OPISTHORCHIS FELINEUS.

Новосибирский государственный университет Возбудитель описторхоза Opisthorchis felineus — плоский червь класса Trematoda, паразит печени млекопитающих (в т. ч. человека), распространён на территории стран СНГ. Жизнедеятельность этого паразита вызывает ряд серьёзных патологий, в их числе холангиты, холецистит, фиброз. Эти заболевания вызываются в том числе продуктами секреции червя. Основными белками клеточной секреторно-экскреторной системы являются белки АТФ-зависимого мембранного транспорта (АВСбелки), представленные у многих видов живых организмов. Они могут не только защищать червя от лекарственных препаратов, но и секретировать ряд патогенных веществ. АВС-белки у O. felineus ранее не были исследованы.

С целью исследования молекулярных механизмов функционирования клеточной секреторно-экскреторной системы червя, были поставлены задачи по идентификации генов АВСВ1-белков, установлению структуры и доменной организации АВС-белков, а также уровней экспрессии генов.

Анализ результатов первичной сборки генома и транскриптома червя с помощью инструментов NCBI (Blast, ORFfinder, CD-search), показал наличие у O. felineus 4 белков подгруппы АВСВ1, получивших индексы PgP 1-4 (от PgP - Р-гликопротеин). Из них три были гомологичны (90%) соответствующим белкам других трематод, а один (PgP 4) — не имел подобных гомологов. Для генов всех белков были реконструированы кодирующие последовательности и интрон-экзонная структура, отсутствующие участки были секвенированы по Сэнгеру с помощью 3' RACE-ПЦР. Был проведён филогенетический анализ белков АВСВ1.

Исследованы уровни экспрессии мРНК PgP 1-4 на различных стадиях жизненного цикла червя, а также их изменение в ответ на антигельминтные препараты с помощью ПЦР в реальном времени.

Таким образом, O. felineus имеет 4 гена белков АВСВ1, в отличие от других видов того же семейства (C. sinensis). Ввиду консервативности их доменов и структуры мы можем предполагать консервативность их функций и их роль в клеточной секреторно-экскреторной системе O.

felineus.

Научный руководитель — канд. биол. наук М. Ю. Пахарукова

ГЕНОФОНД МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК ХУННУ ЗАБАЙКАЛЬЯ

Новосибирский государственный университет Народность хунну – древнее кочевое родоплеменное объединение, с III века до н. э. и до конца II века н. э. населявшее обширные области Центральной Азии и сильно повлиявшее на этногенетические процессы в Евразии. Работа посвящена исследованию структуры генофонда митохондриальной ДНК хунну Забайкалья – самой северной области их распространения. В процессе исследования были проанализированы останки 19 представителей рядового населения хунну из пяти археологических памятников, расположенных к юго-востоку от озера Байкал. Для 16 образцов была установлена структура ГВСI митохондриальной ДНК. В результате в исследованной выборке выявлены линии шести гаплогрупп мтДНК: A, B, C, D, U2, U7. В результате проведенного филогеографического анализа в структуре генофонда митохондриальной ДНК были выявлены три компонента: к первому из них, наиболее многочисленному, относятся варианты гаплогрупп D, C, A.

Эти гаплогруппы являются типичными для современного коренного населения Южной Сибири и Центральной Азии, в частности Забайкалья.

Ко второму компоненту можно отнести две линии гаплогруппы B, относящиеся к подгруппам B4 и B5. Данные филогенетические кластеры являются наиболее характерными для популяций современного Китая и других территорий Юго-Восточной Азии. Третий компонент формируют линии западно-евразийских гаплогрупп U2 и U7. Предполагаемым местом возникновения и диверсификации этих гаплогрупп является территория Передней Азии и Ближнего Востока. Таким образом, присутствие в генофонде хунну Забайкалья групп вариантов мтДНК, филогенетически контрастных по отношению к центрально-азиатским, указывает на генетические контакты хунну с населением удаленных от Забайкалья территорий и высокую мобильность населения в пределах империи хунну.

Научный руководитель – канд. биол. наук А. С. Пилипенко

ПОЛУЧЕНИЕ ЛИНИЙ ЭМБРИОНАЛЬНЫХ СТВОЛОВЫХ

КЛЕТОК ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ НЕЙРОГЕНЕЗА

Новосибирский государственный университет Одно из важных направлений биологии развития – изучение нейрогенеза. На сегодняшний день есть несколько методов, позволяющих целенаправленно и высокоэффективно изменять геном: ZFN, TALEN и CRISPR/Cas9. Для изучения нейрогенеза мы решили создать линию эмбриональных стволовых (ЭС) клеток с EGFP под контролем эндогенного промотора -тубулина III, маркера нейрональных клеток.

Мы получили пять линий ЭС клеток мыши с диплоидным числом хромосом. Для сайт-специфической встройки мы использовали метод TALEN. Трансфекция ЭС клеток конструкцией EGFP/PGAPuro-PA позволила получить клоны у которых вместо стоп-кодона гена -тубулина III вставлена кассета, содержащая репортерный ген EGFP и селективный ген устойчивости к пуромицину. Всего мы получили 179 клонов, из которых 6 имели целевую встройку. Три из них имели диплоидный кариотип. Для проверки функциональности трансгена клоны ЭС клеток дифференцировали в монослое в нейральные клетки. На 9-й и 13-й дни дифференцировки в телах и отростках клеток идентифицировали экспрессию EGFP. Специфичность дифференцировки в нейроны подтвердили с помощью иммуноцитохимического окрашивания на NF200, компонент промежуточных микрофиламентов нейронов. Для усиления сигнала EGFP в нейрональных клетках мы удалили кассету гена устойчивости к пуромицину из клонов ЭС клеток с помощью обработки плазмидой CRE-2A-GFP.

Таким образом, мы получили линии трансгенных ЭС клеток, в которых EGFP коэкспрессируется с эндогенным геном -тубулина III. Эти линии можно использовать для изучения процессов нейральной дифференцировки in vitro. В дальнейшем мы планируем создать новую трансгенную линию мышей, что даст возможность исследовать процессы нейрогенеза не только in vitro, но и in vivo.

Научный руководитель – канд. биол. наук А. Г. Мензоров

МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ И БИОХИМИЯ

STRUCTURAL VARIATION IN CODON 655 HER2 GENE AND

BREAST CANCER

Aitkhozhin Institute of molecular biology and biochemistry, Almaty, Breast cancer (BC) is the most common cancer among women in most of countries. Hereditary, lifestyle, urbanization and growing life expectancy are potential factors of BC risk. The structural changes in the polymorphic sites of coding regions of genome are also the potential factors of BC risk.

HER2 gene encodes a transmembrane protein with tyrosine kinase activity.

The protein product of this gene is involved in the activation of signaling pathways regulating normal growth and development of breast tissue. In the modern classification of HER2 overexpression is used as a prognostic marker and its presence in tumor tissue is associated with a poor prognosis and is an indication for a specific anti-HER2 therapy.

A case-control study of 264 BC patients (mean age 46.4 years) and healthy women (mean age 47.6 years) from Kazakh and Russian ethnic groups of women living in the territory of Kazakhstan was performed. Genotyping was performed by PCR-RFLP methods. The Pearson 2, Fisher exact test, and odds ratio (OR), 95 % confidence intervals (95% CI) were applied to data analysis.

No significant differences for determination alleles frequency and genotype distributions of codon Ile655Val in exon 21 HER2 gene were registered in both ethnic groups (genotypes: p=0.406 and p=0.787 respectively for the Kazakh and Russian groups;

alleles: p=0.237 and p=0.562, respectively). The increased risk of BC was not shown in carriers of Val allele (OR = 0.80 for Kazakh;

OR=1. for Russian groups).

Lack of association of codon Ile655Val with BC was shown for Caucasian, African-American, Latinas, Japanese, Greek, British and German populations.

The increased risk of BC in carriers of Val allele (OR=14.1) was evaluated only for the population of Shanghai China.

Thus we can say that Val allele carrier is not indicative risk factor for breast cancer, at least in the Kazakh and Russian ethnic groups of women who live in the Republic of Kazakhstan.

Scientific adviser – D. Bio. Sc. T. S. Balmukhanov

КОРРЕКЦИЯ ДАЛАРГИНОМ СВОБОДНОРАДИКАЛЬНЫХ

ПРОЦЕССОВ И СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНОГО

СОСТОЯНИЯ МЕМБРАН ПРИ ГИПОТЕРМИИ



Pages:     | 1 |   ...   | 19 | 20 || 22 | 23 |   ...   | 28 |
 


Похожие материалы:

«СОВРЕМЕННЫЕ ТЕНДЕНЦИИ В НАУКЕ И ОБРАЗОВАНИИ Сборник научных трудов по материалам Международной научно-практической конференции Часть IV 3 марта 2014 г. АР-Консалт Москва 2014 1 УДК 001.1 ББК 60 Современные тенденции в науке и образовании: Сборник науч- С56 ных трудов по материалам Международной научно-практической конфе- ренции 3 марта 2014 г. В 6 частях. Часть IV. М.: АР-Консалт, 2014 г.- 172 с. ISBN 978-5-906353-82-5 ISBN 978-5-906353-86-3 (Часть IV) В сборнике представлены результаты ...»

«Палинологическая школа-конференция с международным участием МЕТОДЫ ПАЛЕОЭКОЛОГИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ (Москва, 16-19 апреля 2014) Тезисы докладов International Palynological Summer School METHODS OF PALAEOENVIRONMENTAL RESEARCHES (Moscow, April, 16-19, 2014) Book of abstracts Москва – 2014 УДК 561: 581.33:551.71/.78 Методы палеоэкологических исследований. Тезисы докладов палинологической школы-конференции с международным участием / Ред. А.А. Величко, Н.С. Болиховская, Е.Ю. Новенко, С.С. Фаустов. ...»

«ФОРМИРОВАНИЕ ЭКОЛОГИЧЕСКОЙ КУЛЬТУРЫ И СРЕДА ОБИТАНИЯ НА ТЕРРИТОРИИ УРБОЭКОСИСТЕМ Сборник материалов Всероссийской научной конференции с международным участием (27–28 сентября 2012 года) Шуя 2012 УДК 502.52 Печатается по решению редакционно-издательского совета ББК 28.08 ФГБОУ ВПО Шуйский государственный педагогический Ф 43 университет Ф 43 Формирование экологической культуры и среда обита- ния на территории урбоэкосистем: Сборник материалов Всероссий- ской научной конференции (г. Шуя, 27-28 ...»






 
© 2013 www.kon.libed.ru - «Бесплатная библиотека научно-практических конференций»