БЕСПЛАТНАЯ БИБЛИОТЕКА РОССИИ

НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКИЕ КОНФЕРЕНЦИИ

<< ГЛАВНАЯ
АСТРОНОМИЯ
БЕЗОПАСНОСТЬ
БИОЛОГИЯ
ЗЕМЛЯ
ИНФОРМАТИКА
ИСКУССТВОВЕДЕНИЕ
ИСТОРИЯ
КУЛЬТУРОЛОГИЯ
МАШИНОСТРОЕНИЕ
МЕДИЦИНА
МЕТАЛЛУРГИЯ
МЕХАНИКА
ПЕДАГОГИКА
ПОЛИТИКА
ПРИБОРОСТРОЕНИЕ
ПРОДОВОЛЬСТВИЕ
ПСИХОЛОГИЯ
РАДИОТЕХНИКА
СЕЛЬСКОЕ ХОЗЯЙСТВО
СОЦИОЛОГИЯ
СТРОИТЕЛЬСТВО
ТЕХНИЧЕСКИЕ НАУКИ
ТРАНСПОРТ
ФАРМАЦЕВТИКА
ФИЗИКА
ФИЗИОЛОГИЯ
ФИЛОЛОГИЯ
ФИЛОСОФИЯ
ХИМИЯ
ЭКОНОМИКА
ЭЛЕКТРОТЕХНИКА
ЭНЕРГЕТИКА
ЮРИСПРУДЕНЦИЯ
ЯЗЫКОЗНАНИЕ
РАЗНОЕ
КОНТАКТЫ

загрузка...

Pages:     | 1 |   ...   | 18 | 19 || 21 | 22 |   ...   | 28 |

«МАТЕРИАЛЫ 52-Й МЕЖДУНАРОДНОЙ НАУЧНОЙ СТУДЕНЧЕСКОЙ КОНФЕРЕНЦИИ МНСК–2014 11–18 апреля 2014 г. БИОЛОГИЯ Новосибирск 2014 УДК 15.010 ББК Ю 9 Конференция проводится при поддержке ...»

-- [ Страница 20 ] --

Трансмембранный рецептор FCRL6 принадлежит к недавно описанному семейству белков FCRL (FcR-Like). FCRL6 экспрессируется на поверхности ЦТЛ и NK-клеток. Данные о характере экспрессии FCRL6, а так же наличие в его цитоплазматической части ITIM мотивов, позволяют предположить, что он выступает в качестве ингибирующего рецептора, однако точная его функция остаётся неизвестной.

Дополнительной сложностью в изучении FCRL6 является отсутствие каких-либо клеточных линий, конститутивно экспрессирующих его на своей поверхности.

Для изучения функциональной активности FCRL6 нами была создана Т-лимфомная линия Jurkat, стабильно экспрессирующая FCRL6 и флуоресцентный репортер. Для этого были сконструированы две рекомбинантные плазмиды, кодирующие полноразмерный FCRL6, либо FCRL6 без цитоплазматической части, под контролем промотора EF1. На основе полученных плазмид были наработаны псевдовирусные частицы и произведена трансдукция клеток Jurkat. Эксперименты по in vitro активации полученных трансгенных клеток при помощи кросс-сшивки Тклеточного рецептора показали, что экспрессирующие рецептор FCRL клетки более подвержены апоптозу чем контрольные клетки. Таким образом, FCRL6 оказывает угнетающее воздействие на клеточную активность, смещая баланс выживание-апоптоз в сторону апоптоза у активированных клеток на модели Jurkat.

Научный руководитель – канд. биол. наук Н. А. Чикаев

ДИФФЕРЕНЦИРОВКА ПЛЮРИПОТЕНТНЫХ СТВОЛОВЫХ

КЛЕТОК КРЫСЫ И ДИНАМИКА ПРОЦЕССА ИНАКТИВАЦИИ

Новосибирский государственный университет Плюрипотентные стволовые клетки (ПСК) представляют интерес как потенциальный источник специфических типов клеток в регенеративной медицине, а также являются моделью для изучения событий раннего эмбриогенеза, в том числе процесса инактивации Х-хромосомы.

В настоящее время получены плюрипотентные клетки крысы Rattus norvegicus [1] – модельного объекта для исследования различных заболеваний человека и тестирования действия лекарственных препаратов [2]. Однако использование ПСК крысы в биомедицинских и научных исследованиях ограничено из-за того, что эти клетки оказалось крайне затруднительно дифференцировать [3].

В рамках данной работы был разработан высокоэффективный и воспроизводимый протокол дифференцировки плюрипотентных стволовых клеток крысы в монослое на культуральной поверхности, обработанной коллагеном. Показано, что дифференцировка ПСК крысы в монослое на подложке из коллагена протекает спонтанно в экто-, энто- и мезодермальном направлении и сопровождается синхронным запуском процесса инактивации Х-хромосомы. На инактивируемой Х-хромосоме при этом формируются два типа факультативного гетерохроматина.

Таким образом, разработанный протокол позволяет получать специфические типы клеток крысы для использования в биомедицинских исследованиях, а также изучать такой фундаментальный процесс как инактивация Х-хромосомы.

1. Buehr M. et al. Capture of authentic embryonic stem cells from rat blastocysts // Cell. 2008. Т. 135. №7. С. 1287-1298.

2. Lazar J. et al. Impact of genomics on research in the rat //Genome research. 2005. Т. 15. №12. С. 1717-1728.

3. Cao N. et al. In vitro differentiation of rat embryonic stem cells into functional cardiomyocytes // Cell research. 2011. Т. 21. №9. С. 1316-1331.

Научный руководитель – канд. биол. наук А. И. Шевченко

МОБИЛЬНЫЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЭЛЕМЕНТЫ ПЕРЕМЕЩАЮТСЯ

В ГЕНОМАХ ИЗОГЕННЫХ И ИЗОСАМОЧЬИХ ЛИНИЙ

D. MELANOGASTER

Новосибирский государственный университет Мобильные генетические элементы (МГЭ) – последовательности ДНК, которые могут перемещаться внутри генома. Данные различных исследований показывают, что скрещивания между некоторыми парами линий Drosophila melanogaster индуцируют перемещения МГЭ.

Перемещение же МГЭ в изогенных линиях без скрещиваний с другими линиями – вопрос дискуссионный.

Мы оценили частоту перемещения 7 МГЭ в геноме линии y;

cn bw sp c полностью секвенированным геномом, сравнив локализацию МГЭ по данным FISH (2013-2014 гг.) с данными in silico (1992 г.). Частота перемещения МГЭ колеблется от 2*10-4 (blood) до 5,4*10-3 (I-элемент) перемещений на геном за поколение, при этом корреляции между частотой перемещения и уровнем экспрессии МГЭ не обнаружено.

По нашим данным, частота перемещения одного и того же МГЭ в разных линиях D. melanogaster не совпадает. Мы проанализировали локализацию blood, стабильного в линии y;

cn bw sp в четырех отводках изосамочьей линии Canton S и обнаружили что большая часть сайтов гибридизации уникальна, совпадают лишь единичные сайты гибридизации.

В 3 отводках изосамочьей линии Harwich blood более стабилен, в то же время число сайтов локализации P-элемента значительно отличается (31, 39 и 60 сайтов гибридизации), из которых более 20 сайтов общие для исследованных отводок.

Таким образом, мы показали, что МГЭ перемещаются и в изогенных и изосамочьих линиях D. melanogaster без скрещивания с другими линиями.

Частота перемещения МГЭ не коррелирует с уровнем их экспрессии.

Частота перемещения одного и того же МГЭ не постоянна в различных линиях D. melanogaster. В одной и той же линии разные МГЭ перемещаются с разной скоростью.

Работа выполнена при поддержке гранта РФФИ 14-04-00929, частично поддержана Новосибирским Государственным Университетом.

Научный руководитель - канд. биол. наук, доцент Л. П. Захаренко

СЕКВЕНИРОВАНИЕ И АНАЛИЗ ГЕНОМОВ ПОТЕНЦИАЛЬНО

ТЕРАПЕВТИЧЕСКИХ БАКТЕРИОФАГОВ,

ПРИНАДЛЕЖАЩИХ ПОРЯДКУ CAUDOVIRALES

Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН Применение бактериофагов при лечении бактериальных инфекций имеет ряд преимуществ перед терапией антибиотиками, главные из которых — меньшее количество побочных эффектов и высокая специфичность терапии. Детальная характеризация бактериофагов на основе анализа их геномных последовательностей является необходимым условием для использования бактериофагов в терапии.

Цель настоящей работы – реконструкция и анализ геномных последовательностей четырех потенциально терапевтических фагов, специфичных к Staphylococcus aureus, Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosa, являющихся типичными возбудителями нозокомиальных инфекций. Материал для секвенирования был получен при культивировании бактериофагов на изолятах указанных бактерий с дальнейшим выделением фаговой ДНК. В результате секвенирования парно-концевых библиотек с использованием платформы Illumina Miseq было получено от 17 до 58 тыс. ридов для каждого фага. Сборка de novo была выполнена с применением пакета CLC Genomics Workbench v.6.0.5.

Для каждого бактериофага вся геномная последовательность была реконструирована ассемблером в виде одного контига.

По результатам локального выравнивания BLAST и утилиты кластерного анализа CLANS было установлено, что исследованные бактериофаги относятся к двум семействам: Myoviridae и Siphoviridae, причем два фага из сем. Myoviridae (PH20 и PH64) принадлежат к подсем.

Spounavirinae. С помощью программы BLAST и сервиса Phantome был проведен поиск открытых рамок считывания и установлены предполагаемые функции их продуктов. Были найдены отличия в составе открытых рамок считывания между гомологичными фагами PH20 и PH64, имеющими различную литическую активность в отношении разных изолятов S. aureus. PH57, сем. Myoviridae, был отнесен к группе филетически близких фагов, специфичных к P. aeruginosa. Бактериофаг PH87-1 был отнесен к сем. Siphoviridae, причем процент гомологии с уже известными представителями семейства не превышал 68%.

Научные руководители А. М. Курильщиков, д-р биол. наук Н. В. Тикунова

ЭВОЛЮЦИЯ И РАСПРОСТРАНЕНИЕ МОБИЛЬНЫХ ЭЛЕМЕНТОВ

СУПЕРСЕМЕЙСТВА TC1\MARINER СРЕДИ НАСЕКОМЫХ

ОТРЯДА ORTHOPTERA (INSECTA)

Новосибирский государственный университет Суперcемейство Tc1\mariner является одним из наиболее широко распространённых групп мобильных элементов класса ДНК транспозонов.

Элементы этого семейство в большом числе представлены в геномах плоских червей, кишечнополостных, насекомых, растений и млекопитающих. Транспозоны суперсемейства Tc1/mariner являются относительно короткими мобильными элементами (от 1000 до 5000 п. о.) с концевыми инвертированными повторами, варьирующими по длине от 17 п. о. до 1100 п. о. и кодируют единственный белок – транспозазу. В настоящее время в суперсемействе Tc1/mariner выделяют 7 семейств и несколько десятков подсемейств.

Целью настоящей работы было выяснение распространения и эволюции ДНК транспозонов суперсемейства Tc1/mariner в отряде Orthoptera c помощью биоинформатических и экспериментальных методов исследований.

Для поиска мобильных элементов были использованы виды, представляющие различные таксономические группы отряда Orthoptera, В результате проведенной работы было установлено, что у видов отряда Orthoptera в основном присутствует ДНК транспозоны, принадлежащие нескольким подсемействам семейства mariner, два из которых были описаны впервые. С помощью молекулярно-филогенетического анализа для всех полученных мобильных элементов были установлены их филогенетические взаимоотношения.

Научный руководитель – канд. биол. наук А. Г. Блинов

ПОЛУЧЕНИЕ ХИМЕРНОЙ GFP-КОНСТРУКЦИИ ОПУХОЛЕВОГО

СУПРЕССОРА MERLIN И ИЗУЧЕНИЕ ЕЁ КЛЕТОЧНОЙ

ЛОКАЛИЗАЦИИ В СПЕРМАТОГЕНЕЗЕ D.MELANOGASTER

Новосибирский государственный университет Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН Преимуществом изучения клеточной локализации белка с помощью химерных GFP конструкций является то, что локализация изучается in vivo;

артефакты, связанные с фиксацией, полностью исключены. Также есть возможность изучать динамику поведения белков в клетке и силу связывания белка с внутриклеточной структурой. Целью работы является изучение клеточной локализации опухолевого супрессора Merlin с помощью генетической конструкции, содержащей химерный белок GFPMerlin, у D.melanogaster.

Нами было проведено клонирование кодирующей области гена Merlin в вектор pUASP-EGFP и получена геномная инсерция этой конструкции.

Эктопическая экспрессия трансгена с помощью повсеместного драйвера в соматической ткани показала локализацию белка в цитоплазматических гранулах. В клетках зародышевой линии показано, что белок также локализован в цитоплазматических гранулах. Ранее было показано, что химерный белок Merlin имеет такую же локализацию в клетках культуры тканей дрозофилы. Однако выявление белка с помощью антител к самому белку и выявление белка с помощью антител к Myc эпитопу показывало, что белок помимо цитоплазматических гранул локализуется на клеточном кортексе [1]. В клетках культуры тканей клеточный кортекс отличается от такового у клеток органов, поэтому не было ясно, связано ли отсутствие GFP-Merlin в кортикальной области клеток культуры тканей с особенностями конструкции или с особенностями клеток. Сравнение наших данных с данными работы [1] показало, что локализация белка в цитоплазматических гранулах связана с особенностями конструкции и клеточная локализация белка, полученная нами в эксперименте, отражает только часть общей картины распределения белка в клетке. Но также ясно, что наблюдаемый эффект не связан с "навешиванием" GFP на N-конец белка, так как конструкция GFP-MerlinDBB имеет исключительно кортикальную локализацию в клетках культуры тканей.

1. LaJeunesse et al. // Cell Biology, 1998. Vol. 141. P. 1589-1599.

Научный руководитель – д-р биол. наук Л. В. Омельянчук

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ СЕРЕБРЯНОГО КАРАСЯ

В ВОДОЕМАХ ЮГА ТЮМЕНСКОЙ ОБЛАСТИ

Тюменский государственный университет Серебряный карась Carassius auratus (Cyprinidae)– один из наиболее распространенных видов рыб Евразии. Он обитает в Сибири практически повсеместно и является наиболее традиционным объектом любительского лова. Природные популяции серебряного карася (C.auratus gibelio Bloch) с правильным соотношением полов крайне редки;

широко распространены популяции с численным преобладанием самок и однополые женские популяции с единичными самцами. Серебряный карась известен своей высокой толерантностью ко многим неблагоприятным факторам среды и приспособляемостью к их изменению. Благодаря своей уникальной жизнеспособности, он нередко является единственным представителем ихтиофауны во многих водоемах заморного типа, распространенных на юге Тюменской области. В связи с этим представляет интерес исследование уровня генетической изменчивости и других показателей популяций карася, обитающих в таких экстремальных условиях и, повидимому, регулярно проходящих через «бутылочное горлышко».

Было исследовано 2 популяции карася, обитающего в озерах Андреевское (n = 50) и Чепкуль (n = 50).Генетическую изменчивость рыб изучали методом ISSR-PCR с тремя видами праймеров: (AG)8G, (AG)8T, (CA)8G. ДНК экстрагировали из сердечной мышечной ткани, фиксированной в 70 % этаноле, методом щелочного лизиса. Разделение ПЦР-продуктов проводили в 2% агарозном геле. Расчет стандартных популяционно-генетических характеристик производили с использованием программы POPGEN.

Из 27 исследованных ISSR-PCR бэндов, 21 (77.8 %) были полиморфны.

Показатели генетической изменчивости карася в оз. Андреевское (na = 1.78, ne = 1.49, h = 0.28, I = 0.42) превышают аналогичные в популяции оз.

Чепкуль (na = 1.22, ne = 1.14, h = 0.08, I = 0.12). На долю межпопуляционных различий приходится 16% изменчивости (Gst = 0.16).

Поток генов между популяциями значительный (Nm = 2.56). Однако генетическая дистанция Нея(DN = 0.082) свидетельствует о принадлежности изученных групп к разным популяциям. Таким образом, несмотря на гиногенез и обитание в экстремальных условиях, серебряный карась имеет достаточно высокие показатели генетической изменчивости.

Научный руководитель – канд. биол. наук, доцент О. Н. Жигилева

ВЛИЯНИЕ ДЕЛЕЦИЙ НЕКОДИРУЮЩИХ УЧАСТКОВ

ХРОМОСОМ НА ПРОСТРАНСТВЕННУЮ ОРГАНИЗАЦИЮ

ГЕНОМА В ЭМБРИОНАЛЬНЫХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТКАХ МЫШИ

Новосибирский государственный университет Пространственная организация генома играет важную роль в регуляции активности генов. Компактизация хроматина, обеспечивая определенную укладку нитей ДНК, влияет на образование межгенных взаимодействий.

Недавние исследования показали существование дополнительного уровня компактизации на стадии интерфазы – уровня топологических доменов. Участки ДНК, расположенные внутри одного топологического домена, контактируют между собой значительно чаще, чем участки соседних доменов, которые практически не взаимодействуют друг с другом. Характерный размер домена - ~1 миллион пар оснований.

На сегодняшний день остается неясным, каким образом определяются границы доменов, какое влияние оказывают домены на экспрессию генов, могут ли хромосомные перестройки воздействовать на доменную организацию?

Целью данной работы является исследование принципов организации топологических доменов путем удаления междоменных и внутридоменных фрагментов генома в эмбриональных стволовых клетках (ЭСК) мыши.

С помощью компьютерного анализа были выбраны два участка для внесения делеций: междоменный участок (68 тысяч пар оснований) между генами Cdc7 и Tgfbr3, а также внутридоменный участок (85 тысяч пар оснований) вблизи генов C-kit и Kdr. Оба фрагмента расположены на 5й хромосоме и не содержат кодирующих последовательностей. Гены вблизи делеций (Cdc7, Tgfbr3, C-kit, Kdr) имеют значимую активность в ЭСК.

Были сконструированы и подготовлены генетические векторы на основе системы редактирования генома CRISPR/CAS9, обеспечивающие направленное удаление выбранных фрагментов генома.

В данный момент ведется работа по созданию двух клеточных линий, несущих внутридоменную и междоменную делеции соответственно.

Последующий анализ районов генома, фланкирующих делеции, методом 5С позволит установить принципы организации хроматина в топологические домены.

Научный руководитель – канд. биол. наук Н. Р. Баттулин

СОЗДАНИЕ ИНСТРУМЕНТОВ ДЛЯ ИСПРАВЛЕНИЯ

ГЕНЕТИЧЕСКОЙ МУТАЦИИ В ПЛЮРИПОТЕНТНЫХ КЛЕТКАХ

КРЫС ЛИНИИ BRATTLEBORO



Pages:     | 1 |   ...   | 18 | 19 || 21 | 22 |   ...   | 28 |
 


Похожие материалы:

«СОВРЕМЕННЫЕ ТЕНДЕНЦИИ В НАУКЕ И ОБРАЗОВАНИИ Сборник научных трудов по материалам Международной научно-практической конференции Часть IV 3 марта 2014 г. АР-Консалт Москва 2014 1 УДК 001.1 ББК 60 Современные тенденции в науке и образовании: Сборник науч- С56 ных трудов по материалам Международной научно-практической конфе- ренции 3 марта 2014 г. В 6 частях. Часть IV. М.: АР-Консалт, 2014 г.- 172 с. ISBN 978-5-906353-82-5 ISBN 978-5-906353-86-3 (Часть IV) В сборнике представлены результаты ...»

«Палинологическая школа-конференция с международным участием МЕТОДЫ ПАЛЕОЭКОЛОГИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ (Москва, 16-19 апреля 2014) Тезисы докладов International Palynological Summer School METHODS OF PALAEOENVIRONMENTAL RESEARCHES (Moscow, April, 16-19, 2014) Book of abstracts Москва – 2014 УДК 561: 581.33:551.71/.78 Методы палеоэкологических исследований. Тезисы докладов палинологической школы-конференции с международным участием / Ред. А.А. Величко, Н.С. Болиховская, Е.Ю. Новенко, С.С. Фаустов. ...»

«ФОРМИРОВАНИЕ ЭКОЛОГИЧЕСКОЙ КУЛЬТУРЫ И СРЕДА ОБИТАНИЯ НА ТЕРРИТОРИИ УРБОЭКОСИСТЕМ Сборник материалов Всероссийской научной конференции с международным участием (27–28 сентября 2012 года) Шуя 2012 УДК 502.52 Печатается по решению редакционно-издательского совета ББК 28.08 ФГБОУ ВПО Шуйский государственный педагогический Ф 43 университет Ф 43 Формирование экологической культуры и среда обита- ния на территории урбоэкосистем: Сборник материалов Всероссий- ской научной конференции (г. Шуя, 27-28 ...»






 
© 2013 www.kon.libed.ru - «Бесплатная библиотека научно-практических конференций»